Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col4a3Q9QZS0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms