Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh11Q9QYF1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms