Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc5Q9QX29 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms