Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tlr5Q9JLF7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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