Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nectin3Q9JLB9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nectin3Q9JLB9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nectin3Q9JLB9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nectin3Q9JLB9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Nectin3Q9JLB9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Nectin3Q9JLB9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Nectin3Q9JLB9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Nectin3Q9JLB9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Nectin3Q9JLB9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Nectin3Q9JLB9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Nectin3Q9JLB9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nectin3Q9JLB9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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