Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc28a3Q9ERH8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Slc28a3Q9ERH8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Slc28a3Q9ERH8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc28a3Q9ERH8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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