Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms