Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim23Q9DAL0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms