Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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