Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms