Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Derl3Q9D8K3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms