Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms