Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms