Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl53Q9D1H8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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