Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TbcbQ9D1E6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms