Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2cQ9D1C1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms