Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mis12Q9CY25 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mis12Q9CY25 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms