Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot11Q9CWN7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cnot11Q9CWN7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cnot11Q9CWN7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cnot11Q9CWN7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cnot11Q9CWN7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cnot11Q9CWN7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Cnot11Q9CWN7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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