Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Psma8Q9CWH6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Psma8Q9CWH6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Psma8Q9CWH6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Psma8Q9CWH6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Psma8Q9CWH6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Psma8Q9CWH6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Psma8Q9CWH6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Psma8Q9CWH6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psma8Q9CWH6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms