Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Fcf1Q9CTH6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Fcf1Q9CTH6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Fcf1Q9CTH6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Fcf1Q9CTH6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Fcf1Q9CTH6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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