Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snw1Q9CSN1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms