Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Ifitm3Q9CQW9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifitm3Q9CQW9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms