Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mrpl35Q9CQL6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mrpl35Q9CQL6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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