Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccer1Q9CQL2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms