Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb9Q9CQJ8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms