Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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