Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2aQ99KJ0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms