Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms