Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ctu1Q99J10 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ctu1Q99J10 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ctu1Q99J10 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ctu1Q99J10 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ctu1Q99J10 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ctu1Q99J10 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ctu1Q99J10 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ctu1Q99J10 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ctu1Q99J10 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ctu1Q99J10 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ctu1Q99J10 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctu1Q99J10 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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