Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim59Q922Y2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms