Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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