Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf6Q91YR7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf6Q91YR7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf6Q91YR7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf6Q91YR7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf6Q91YR7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf6Q91YR7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf6Q91YR7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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