Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms