Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PpcsQ8VDG5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms