Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hecw1Q8K4P8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms