Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vrk3Q8K3G5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms