Protein–RNA interactions for Protein: Q8K025

Frat2, GSK-3-binding protein FRAT2, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat2Q8K025 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Frat2Q8K025 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms