Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc4a8Q8JZR6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc4a8Q8JZR6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc4a8Q8JZR6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc4a8Q8JZR6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc4a8Q8JZR6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc4a8Q8JZR6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc4a8Q8JZR6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc4a8Q8JZR6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc4a8Q8JZR6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Slc4a8Q8JZR6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Slc4a8Q8JZR6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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