Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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