Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pramef8Q8CE24 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms