Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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