Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms