Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms