Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hdac7Q8C2B3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdac7Q8C2B3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms