Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek11Q8C0Q4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms