Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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