Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmod1Q8BVA4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms