Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms