Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf187Q8BFX1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf187Q8BFX1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf187Q8BFX1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf187Q8BFX1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf187Q8BFX1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf187Q8BFX1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf187Q8BFX1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rnf187Q8BFX1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rnf187Q8BFX1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rnf187Q8BFX1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rnf187Q8BFX1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf187Q8BFX1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf187Q8BFX1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf187Q8BFX1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf187Q8BFX1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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