Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpped1Q8BFS6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms